Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC17Q9NP64 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC17Q9NP64 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms