Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F12Q9HCS2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms