Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNA4Q9HCM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms