Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC4Q9HBW1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms