Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms