Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms