Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF41Q9H4P4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms