Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOJQ9H4E5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms