Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms