Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB17Q9H0T7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB17Q9H0T7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms