Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NACA2Q9H009 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms