Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE41Q9C0J9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms