Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms