Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NLRP1Q9C000 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms