Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM8Q9BZR9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms