Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms