Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms