Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms