Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms