Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms