Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT11Q9BT88 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT11Q9BT88 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT11Q9BT88 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms