Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms