Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms