Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACBD6Q9BR61 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD6Q9BR61 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms