Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms