Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIN2AQ99865 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIN2AQ99865 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIN2AQ99865 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIN2AQ99865 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIN2AQ99865 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIN2AQ99865 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN2AQ99865 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms