Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP8Q99708 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP8Q99708 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms