Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHP1Q99653 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms