Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POP1Q99575 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POP1Q99575 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POP1Q99575 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POP1Q99575 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POP1Q99575 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POP1Q99575 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POP1Q99575 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POP1Q99575 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms