Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMD1Q99460 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD1Q99460 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms