Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KC1Q96S38 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms