Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IFT140Q96RY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFT140Q96RY7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms