Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms