Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHF12Q96QT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms