Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms