Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRNT1Q96Q11 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRNT1Q96Q11 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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