Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms