Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1Q96NA8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms