Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF560Q96MR9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF560Q96MR9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms