Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC138Q96M89 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms