Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms