Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPGRIP1Q96KN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRIP1Q96KN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms