Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCARF2Q96GP6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF2Q96GP6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF2Q96GP6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF2Q96GP6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF2Q96GP6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms