Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms