Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDC3Q96F86 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms