Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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