Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MALSU1Q96EH3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms