Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO17Q96EF6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FBXO17Q96EF6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms