Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC5Q96DU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms