Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD4Q96DM1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms